Mendel 14.3
Mendel یک پکیج نرم افزاری جامع برای آنالیز آماری صفات کیفی و کمی از لحاظ ژنتیکی است. آپشن های این نرم افزار شامل موارد زیر می شود:
order and map a set of markers along a chromosome
use parametric linkage methods to localize a gene on a fixed marker map
use non-parametric linkage (NPL) methods to localize a gene on a fixed marker map
estimate pedigree haplotypes
identify potential genotyping errors
test for allelic association by the TDT or the gamete-competition model
estimate kinship coefficients conditional on marker data
perform genetic risk calculations
test for paternity or other pedigree relationships
estimate allele frequencies using either pedigrees or a random sample
estimate trait genotype penetrances
estimate ethnic composition using pedigree data
identify deviations from Hardy-Weinberg and linkage equilibrium
simulate genetic data by gene dropping
localize QTLs, including X-linked QTLs, using variance component analysis
perform association analysis on quantitative traits
test for association given linkage and
trim pedigrees to a core group and all necessary connecting relatives
dense SNP genotype imputation, including haplotypes
GWAS: dense SNP association testing, including rare variants
maternal-fetal genotype incompatibility test
inbred strain QTL analysis
simulate trait values incorporating major loci and various models
pedigree-based GWAS (SNP association testing)
این نرم افزار مثال های زیادی را در قالب فایل های ورودی و خروجی در خود دارد که می توان برای یادگیری از آن ها استفاده کرد.
راهنمای نرم افزار (به زبان انگلیسی)
برای دانلود نرم افزار ابتدا بایستی در سایت http://www.genetics.ucla.edu/software/registration ثبت نام کنید و سپس با وارد کردن ایمیل خود در سایت نرم افزار را دانلود نمایید.
مدیر وبلاگ: