نرم افزار MapChart 2.3

MapChart نرم افزاری ساده ولی کاربردی برای ترسیم نقشه کرموزومی از داده های لینکاژ ژنتیکی و QTL است. این چارت ها به شکل میله های عمودی هستند که نشان دهنده گروه های لینکاژی یا کروموزوم هاست. روی این میله ها، مکان لوکوس ها نشان داده می شود و در کنار آن می توان فواصل QTL و گراف های QTL را مشاهده کرد. این نرم افزار اطلاعات لینکاژی (یعنی نام لوکوس و QTL و موقعیتشان) را از روی فایل متنی (text file) می خواند. این اطلاعات بایستی از قبل محاسبه و تهیه شده باشد که معمولاً با نرم افزارهای نقشه یابی ژنتیکی مانند JoinMap و MapQTL بدست می آیند.

 

 این نرم افزار را می توانید بصورت رایگان از لینک زیر دریافت نمایید:

 (477 KB)  دانلود

 

توجه: برای دریافت لایسنس، ابتدا در سایت نرم افزار (لینک پایین)، فرم مربوطه را تکمیل کنید. لایسنس به ایمیلتان ارسال خواهد شد و بایستی آن را در پوشه نرم افزار کپی کنید تا نرم افزار فعال شود.

لینک دریافت لایسنس

 

ویرایش ژن و ژنوم (Gene and Genome Editing) با فناوری CRISPR

کریسپر (CRISPR) مخفف عبارت Clustered regularly interspaced short palindromic repeats است که قطعاتی از DNA پروکاریوتی شامل تکرارهای کوتاهی از توالی نوکلئوتیدی است. این تکرارها برای اولین بار در دهه 1980 در باکتری E. Coli کشف شدند ولی عمکردشان تا سال 2007 مشخص نبود. تا اینکه در این سال آقای رودولف بارانگو (Rodolphe Barrangou) و همکارانش توانستند نشان دهند که باکتری Streptococcus thermophilus می تواند این مقاومت را بر علیه باکتریوفاژ داشته باشد. لوکوس های کریسپر دارای ترکیبی از ژن های مرتبط با کریسپر (Cas) و همچنین عناصر RNA غیر کننده هستند که باعث برش هدفمند نوکلئیک اسید می گردد. در واقع عملکرد کریسپرها و Cas ها باعث این ایمنی می شوند. تا به حال سه نوع سیستم کریسپر (I-III)شناسایی شده است که نوع دو II بیشتر مطالعه گردیده است. یک ویژگی مهم هر لوکوس کریسپر، وجود یک آرایه از توالی های تکراری (تکرارهای مستقیم) است که بوسیله تکه های کوتاهی از توالی های غیرتکراری (spacers) از هم فاصله گرفته اند. آنزیم اندونوکئاز Cas کار برش DNA ویروس را به دو تکه انجام می دهد و باعث جلوگیری از همانندسازی ویروس می شود. تعدادی از آنزیم های Cas وجود دارند که که شناخته شده ترین آن ها Cas9 است.

در واقع سیستم CRISPR/Cas یک سیستم ایمنی پروکاریوتی است که باعث مقاومت به عناصر ژنتیکی خارجی مانند DNA فاژها می شود. همانند روش تداخل RNA (RNAi) که در موجودات یوکاریوتی وجود دارد. کریسپرها در 40 درصد از ژنوم باکتری های توالی یابی شده و در 90 درصد از آرکئی باکتری های یافت می شوند.

از این سیستم می تواند در درمان بیماری های ژنتیکی با استفاده ار تفییر در ژن عامل بیماری (gene therapy) استفاده کرد از جمله سرطان، هپاتیت

شکل زیر نمایی از این مکانیسم دفاع پروکاریوتی ضد ویروسی را نشان می دهد.

 

 ویدیو آموزشی نحوه عمل سیستم CRISPR/Cas را می توانید از لینک های زیر دانلود نمایید:

( 1    2   3   4 )