Clone Manager Professional 9.2

Clone Manager Professional نرم افزار جامعی شامل مجموعه ای از ابزارها برای کلون سازی، برش ها و اتصالات آنزیمی، همردیف کردن توالی ها، یافتن تشابهات، طراحی پرایمر و .... می باشد.

از جمله قابلیت های این نرم افزار می توان به موارد زیر اشاره کرد:

- نمایش و ویرایش فایل های توالی

- یافتن نقاط برش آنزیم ها و نمایش اطلاعات آنزیم و انجام آنالیز برش آنزیمی

- برش، اتصال DNA و تغییر انتهای مولکول

- کلون سازی Gateway و TOPO

- ترسیم نقشه های گرافیکی با کیفیت

- جستجو برای پرایمرها، آنالیز آن ها و BLAST پرایمرها

- یافتن ORF

- ترجمه ژن ها

و بسیاری قابلیت های دیگر

 

برای دریافت نسخه کامل این نرم افزار با ایمیل زیر مکاتبه فرمایید (قیمت 50 هزار تومان)

sajjad.mansoury@yahoo.com

 

 

Canoco 5

کانوکو (Canoco) یکی از محبوبترین نرم افزارها برای انالیزهای آماری چند متغیره با استفاده از روش های دسته بندی (Ordination) در رشته های اکولوژی است. این برنامه روش هایی متنوع و جدیدی در دسته بندی، از جمله تقسیم تنوع (variation partitioning)، تحلیل هم تناظری (co-correspondence analysis)، تحلیل افزونگی مبتنی بر فاصله (distance-based redundancy analysis) و دسته بندی محدود دوگانه (double constrained ordination) برای ارتباط صفت-محیط را می تواند انجام دهد.

از قابلیت های مهم این نرم افزار می توان به موارد زیر اشاره کرد:

- وارد کردن فایل داده اکسل بصورت مستقیم و ویرایش آن

- انجام روش های DCA، CA، CCA، DCCA، PCA و RDA

- آزمون های جایگشت مونته کارلو

- ابزارهای نمایش متعدد (مدل های Loess ، GLM و GAM برای نمایش خصوصیات داده روی فضای دسته بندی)

- معیارهای فاصله متعدد ( ضرایب Bray-Curtis، Gower، Jaccard و ...)

- گزینش گام به گام متغیرهای پیشگویی کننده

و ...

 

برای دریافت این نرم افزار با ایمیل زیر مکاتبه فرمایید (قیمت 50 هزار تومان)

sajjad.mansoury@yahoo.com

 

 

معرفی دو نرم افزار کاربردی در تحقیقات کشاورزی ارائه شده توسط سیمیت (CIMMYT)

معرفی دو نرم افزار کاربردی در تحقیقات کشاورزی ارائه شده توسط سیمیت (CIMMYT)

- META-R (Multi Environment Trail Analysis with R for Windows):

این نرم افزار شامل مجموعه ای از برنامه های R برای تجزیه های آماری است که از جمله کارکردهای آن می توان به موارد زیر اشاره کرد:

محاسبه پارامترهای BLUE و BLUP، همبستگی های ژنتیکی بین مکان ها و همبستگی های ژنتیکی بین متغیرها، وراثت پذیری عمومی و دیگر آماره ها برای آزمایشات اصلاحی، ساخت نمودارهای جعبه ای و هیستوگرام. امکان انجام آنالیزها بر اساس مکان، در بین شرایط محیطی و در بین همه مکان ها وجود دارد. این نرم افزار دارای رابط گرافیکی جاوا می باشد که به کاربر کمک می کند به راحتی بتواند فایل های ورودی داده ها، نوع آنالیز مد نظر و متغیرهای مورد بررسی را انتخاب کند.

 

دانلود META-R:

https://data.cimmyt.org/api/access/datafile/9090?gbrecs=true

 

- BIO-R (Biodiversity analysis with R for Windows):

این نرم افزار شامل مجموعه ای از برنامه های R است که آنالیز تنوع زیستی داده های مولکولی را انجام می دهد. از جمله کارکردهای آن می توان به موارد زیر اشاره کرد:

محاسبه هتروزیگوسیتی، تنوع بین و درون گروه ها، شاخص شانون، تعداد الل موثر، درصد لوکوس های پلی مورفیک، فاصله های ژنتیکی Rogers و Nei، تجزیه کلاستر، مقیاس بندی چند بعدی با پلات های دو بعدی و سه بعدی و ...

 

دانلود BIO-R:

https://data.cimmyt.org/api/access/datafile/9087?gbrecs=true

 

- ADEL-R (Analysis and design of experiments with R for Windows):

این نرم افزار شامل مجموعه ای از برنامه های R است که برای ایجاد و آنالیز طرح های آزمایشی کاربرد دارد. خروجی آن جدول های تجزیه واریانس (ANOVA) و گراف های مقایسه میانگین است. طرح هایی مانند طرح بلوک های کامل تصادفی، طرح بلوک های ناقص طرح آگمنت ( حجیم شده)، طرح کرت های خرد شده، طرح های فاکتوریل، طرح کرت های نواری. این نرم افزار دارای رابط گرافیکی جاوا است که استفاده آسان از آن را برای کاربر میسر می سازد.

 

دانلود ADEL-R:

https://data.cimmyt.org/api/access/datafile/9569?gbrecs=true

 

 

PRIMER 6

Plymouth Routines In Multivariate Ecological Research) PRIMER)  یک پکیج آماری است که شامل مجموعه ای از روش های تخصصی یک متغیره، چند متغیره برای آنالیز داده های حاصل از نمونه گیری گونه ها است که در تحقیقات اکولوژی کاربرد فروان دارند. این روش ها شامل موارد زیر می شوند:

- گروه بندی سلسله مراتبی نمونه ها (CLUSTER)

- مقیاس بندی چند بعدی (MDS) غیر متریک

- تجزیه به مولفه های اصلی (PCA)

- آزمون تشابهات (ANOSIM) مبتنی بر جایگشت

- آنالیز درصد تشابه (SIMPER) به منظور شناسایی گونه های نشان دهنده تفرق بین دو گروه

- همبستگی و ارتباط الگوهای زیستی چند متغیره با مجموعه ای از متغیرهای محیطی (BEST و LINKTREE)

- آزمون های مقایسه ای مانند مانتل بر روی ماتریس های تشابه (RELATE)

- اندیس های تنوع استاندارد ، پلات های غالبیت، توزیع های هندسی فراوانی

 و ...

 

نسخه آزمایشی این نرم افزار را می توانید از لینک زیر دانلود نمایید.

https://www.dropbox.com/s/c8xptra06kxatin/PRIMER6_1_8.msi?dl=0

 

برای دریافت لایسنس این نرم افزار با ایمیل زیر مکاتبه فرمایید (قیمت 50 هزار تومان)

sajjad.mansoury@yahoo.com