نرم افزار 3 Primer Express

Primer Express نرم افزاری برای طراحی پرایمرها و پروب ها است که مخصوصاً در Real-Time PCR کاربرد دارد. از ویژگی های این نرم افزار می توان به موارد زیر اشاره کرد:

 طراحی اتوماتیک یا دستی

طراحی همزمان چندین فایل توالی

ابزار تست پرایمر و پروب برای ارزیابی Tm، درصد GC، طول و ساختار ثانویه

طراحی پرایمرها و پروب های ®TaqMan و رنگ  Green®SYBR برای آزمایش های کمی (Quantification Assay) و تمایز آللی (Allelic Discrimination)

 

نسخه آزمایشی (Demo) این نرم افزار را میتوانید از لینک زیر دانلود نمایید:

دانلود

 

  فایل راهنمای استفاده از نرم افزار در لینک زیر قرار دارد:

دانلود

 

یک فیلم آموزشی از نحوه کار با نرم افزار هم تو سایت یوتیوب هستش:

مشاهده فیلم آموزشی

(32.9 مگابایت)

 

برای خرید کرک این نرم افزار با شماره ۰۹۱۸۳۴۱۶۴۵۷ تماس بگیرید. 

قیمت 50000 تومان می باشد.

 

پلاستیدها، ژنوم پلاستیدها و انتقال ژن به پلاستیدها

 

فایل Word حاوی مطالبی راجع به ژنوم پلاستیدها (کلروپلاست) که از منابع مختلف لاتین ترجمه کرده ام و حدود 30 صفحه می باشد به فروش می رسد

سرفصل های این فایل شامل موارد زیر است:

تعداد نسخه ژنوم های پلاستیدی
سازماندهی ژنوم های پلاستیدی در نوکلئوئیدها
تکرارهای معکوس و نواحی تک نسخه ای
میزان اطلاعات ژنوم های پلاستیدی
ژن های فتوسنتزی
ژن های سیستم ژنتیکی
دیگر ژن ها و چارچوب های قرائت باز حفاظت شده
توارث ژنوم های پلاستیدی
پیامدهای بیوتکنولوژی توارث پلاستیدی
تراریختگی ژنتیکی پلاستیدها
 

برای خرید این فایل با ایمیل [e-mail] تماس بگیرید. 

قیمت 30000 تومان

 

نرم افزار SeqMonk

SeqMonk نرم افزاری برای مشاهده و آنالیز داده های توالی نقشه یابی شده است. از ویژگی های مهم این نرم افزار می توان به موارد زیر اشاره کرد:

وارد کردن داده های نقشه یابی شده از پایگاه های (BAM/SAM/bowtie و غیره)

ایجاد گروه داده ها برای مشاهده و آنالیز نواحی نقشه یابی شده در یک ژنوم

سنجش داده های نقشه یابی شده برای مقایسات بین مجموعه ای از داده ها

آنالیز آماری داده ها برای یافتن نواحی مورد نظر

ایجاد گزارش هایی حاوی تفسیرهای داده و ژنوم

 

این نرم افزار را می توانید بصورت رایگان از لینک زیر دریافت نمایید

دانلود

 

نرم افزار UGENE

 

UGENE یکی از جامع ترین نرم افزارهای بیوانفورماتیک برای آنالیز داده های زیستی مختلف مانند توالی ها، جزییات توالی ها (annotations)، همردیفی های چندگانه، درخت های فیلوژنتیکی، NGS، اسمبلی ها و... به شمار می رود. این نرم افزار شامل مجموعه ای از ابزارها و الگوریتم ها در زمینه ژنومیکس، زیست شناسی تکاملی، ویروس شناسی و ... است. این نرم افزار برای سیستم عامل های ویندوز، لینوکس و Mac ارائه شده است. از ویژگی های این نرم افزار می توان به موارد زیر اشاره کرد:

ساخت، ویرایش و نمایش توالی های اسید نوکلئیک و پروتئین

جستجوی سریع در یک توالی

همردیفی های چندگانه توالی: ClustalW, ClustalO, MUSCLE, Kalign, MAFFT, T-Coffee

جستجو درون پایگاه های اطلاعاتی آنلاین (NCBI, PDB, UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL, DAS servers)

جستجوی BLAST بصورت دستی و درون NCBI

کاوشگر ORF

کاوشگر آنزیم های برشی با استفاده از لیست آنزیم های برشی REBASE

پکیج تلفیق شده Primer3 برای طراحی پرایمر PCR

ساخت و نمایش پلاسمید

کلون سازی in silico بوسیله طراحی حامل های کلون سازی

نمایش داده های توالی یابی NGS (فایل های BAM) با استفاده از مرورگر Assembly Browser

آنالیز داده های RNA-seq

آنالیز داده های ChIP-seq

و بسیاری از موارد دیگر که برای اطلاع از آن ها می توانید اینجا را ببینید

 

برای دانلود این نرم افزار به لینک زیر مراجعه فرمایید

دانلود

 

راهنمای استفاده از نرم افزار را هم از لینک زیر دانلود نمایید

دانلود

نرم افزار SimVector 4.6

SimVector نرم افزاری برای ترسیم نقشه های پلاسمیدی خطی و حلقوی با رنگ ها و الگوهای مختلف است. نمایش مکان کلون سازی چندگانه (MCS) و آنزیم ها، طراحی و شبیه سازی آزمایش های کلون سازی (TA و Gateway)، ویرایش توالی ها، کلون سازی و آنالیز برشی، جستجوی ORF و ... از قابلیت های این نرم افزار است.

 

نسخه آزمایشی این نرم افزار (Demo) را می توانید از لینک زیر دانلود نمایید:

دانلود

(28.79 مگابایت)

 

برای خرید کرک نرم افزار (نسخه فول) با شماره ۰۹۱۸۳۴۱۶۴۵۷ تماس بگیرید. 

قیمت 50000 تومان

 

jModelTest و ModelTest

jModelTest نرم افزاری برای انتخاب آماری مدل هایی با بهترین برازش جابجایی های نوکلئوتیدی است. این مدل ها برای ساخت درخت های فیلوژنتیکی استفاده می شوند. این ابزار از پنج راهکار مختلف انتخاب مدل برای مجموعه ای از توالی های همردیف شده استفاده می کند: آزمون های نسبت احتمال دینامیکی و سلسله مراتبی (hLRT و dLRT)، معیارهای اطلاعاتی آکائیک و بیزی (AIC و BIC) و روش تئوری تصمیم گیری (DT). همچنین این برنامه راهکارهای جدیدی برای بهینه سازی درخت، درخت های فیلوژنتیکی متوسط-مدل (هم توپولوژی و هم طول شاخه)، فیلترینگ ابتکاری و ورود اتوماتیک فعالیت کاربر ارائه می کند. این نرم افزار می تواند در دو محیط مختلف اجرا شود. یکی رابط گرافیکی کاربر (GUI) و دیگری مبتنی بر برنامه نویسی (Console). چون این نرم افزار یک برنامه مبتنی بر جاوا است، بایستی روی سیستم شما Java Runtime Environment  نصب باشد.

 توجه: نرم افزار مشابه ای وجود دارد که ModelTest نام دارد ولی برای استفاده از آن باید نرم افزار *PAUP را نیز همراه آن نصب کنید.

 

 

این نرم افزار را می توانید بصورت رایگان از لینک زیر دانلود نمایید:

دانلود

 

راهنمای استفاده از نرم افزار را نیز از لینک زیر دریافت نمایید:

دانلود