نرم افزار آنلاین ترسیم نقشه های ژنومی اندامکی (OGDRAW)

 

OGDRAW نرم افزار آنلاینی برای ترسیم نقشه های ژنومی اندامکی (کلروپلاست و میتوکندری) با کیفیت بالاست که توسط موسسه ماکس پلانک آلمان طراحی شده است. برای استفاده از این نرم افزار بایستی ابتدا وارد زیر شد:

http://ogdraw.mpimp-golm.mpg.de/cgi-bin/ogdraw.pl

پس از ورود به سایت، فایل GenBank مربوط به توالی ژنومی اندامک یا وارد نمونه شماره دسترسی (Accession Number) آن را وارد می کنیم و سپس بر روی گزینه Submit Sequence کلیک می کنیم.

در صفحه بعد می توان ویژگی های نقشه ژنومی از جمله فتوسیستم I و ORF ،II ها، RNA های ریبوزومی، اینترون ها، نقشه شروع همانندسازی و ... را به دلخواه انتخاب کرد. همچنین می توان نوع فایل گرافیکی خروجی و کیفیت آن را تعیین کرد. در نهایت با کلیک بر روی گزینه Create map می توان نقشه ژنومی اندامک گونه مورد نظر را مشاهده و ذخیره کرد.

 

اطلاعات ژنوم اندامکی موجودات مختلف در سایت زیر قابل دسترسی است:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/browse/?report=5

 

راهنمای فارسی همردیفی (Alignment) و BLAST

دوستان و همراهان عزیز وبلاگ، راهنمای فارسی همردیف کردن (Alignment) توالی ها و نحوه استفاده از BLAST در دو فایل جداگانه در اختیار شما عزیزان قرار می گیرد. امیدوارم مفید واقع شود

 

قسمت اول

قسمت دوم