UGENE یکی از جامع ترین نرم افزارهای بیوانفورماتیک برای آنالیز داده های زیستی مختلف مانند توالی ها، جزییات توالی ها (annotations)، همردیفی های چندگانه، درخت های فیلوژنتیکی، NGS، اسمبلی ها و... به شمار می رود. این نرم افزار شامل مجموعه ای از ابزارها و الگوریتم ها در زمینه ژنومیکس، زیست شناسی تکاملی، ویروس شناسی و ... است. این نرم افزار برای سیستم عامل های ویندوز، لینوکس و Mac ارائه شده است. از ویژگی های این نرم افزار می توان به موارد زیر اشاره کرد:

ساخت، ویرایش و نمایش توالی های اسید نوکلئیک و پروتئین

جستجوی سریع در یک توالی

همردیفی های چندگانه توالی: ClustalW, ClustalO, MUSCLE, Kalign, MAFFT, T-Coffee

جستجو درون پایگاه های اطلاعاتی آنلاین (NCBI, PDB, UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL, DAS servers)

جستجوی BLAST بصورت دستی و درون NCBI

کاوشگر ORF

کاوشگر آنزیم های برشی با استفاده از لیست آنزیم های برشی REBASE

پکیج تلفیق شده Primer3 برای طراحی پرایمر PCR

ساخت و نمایش پلاسمید

کلون سازی in silico بوسیله طراحی حامل های کلون سازی

نمایش داده های توالی یابی NGS (فایل های BAM) با استفاده از مرورگر Assembly Browser

آنالیز داده های RNA-seq

آنالیز داده های ChIP-seq

و بسیاری از موارد دیگر که برای اطلاع از آن ها می توانید اینجا را ببینید

 

برای دانلود این نرم افزار به لینک زیر مراجعه فرمایید

دانلود

 

راهنمای استفاده از نرم افزار را هم از لینک زیر دانلود نمایید

دانلود